岐阜県のほぼ中央部に位置しています。東部は下呂市に接し、北部は高山市に、西部は関市、福井県大野市に、南部は美濃市、関市に接しています。
また、郡上市の地勢は、最低海抜地の美並町木尾(こんの)が110m、最高海抜地の白鳥町銚子ヶ峰が1,810mと高低差が大きく、長良川の源流部にあたる高鷲町の大日山麓一帯にはひるがの高原・上野高原が、明宝水沢上(みぞれ)一帯には、めいほう高原が広がっており、雄大な自然に囲まれたロケーションとなっています。さらに、長良川をはじめとして和良川、石徹白川(いとしろがわ)など一級河川が24本あり、山林の高い水源かんよう能力によって、美しく豊かな水に恵まれています。